英偉達BioNeMo Agent Toolkit助力生命科學研究人員，與Claude Science集成加速AI應用

生命科學已經進入計算規模的時代。十多年來，英偉達構建了完整的GPU加速計算堆棧，涵蓋硬件、框架、庫、模型、微服務和領域特定工具，幫助研究人員運行更復雜的工作流並更快迭代。本週，Anthropic推出了Claude Science，這是一個面向科學研究的人工智能工作台，允許科學家通過自然語言與代理對話，端到端地執行研究工作。

Claude Science集成了英偉達BioNeMo Agent Toolkit，作為科學家可以在其工作流中訪問的資源。該工具包將英偉達加速能力打包為可調用的技能，使Claude Science能夠選擇合適的工具、準備有效輸入並執行工作流——同時連接部署在任何地方的英偉達計算資源。這將英偉達的加速模型、庫和NIM微服務直接帶入與其餘研究相同的環境。

全球最大的製藥公司正在利用英偉達技術推進藥物發現、基因組學、醫學影像、分子設計和蛋白質工程等領域的AI驅動研究。如今，全球前20大製藥公司中有18家使用英偉達BioNeMo，突顯了其在生態系統中的廣泛作用。

推動科學發現的代理時代

Claude Science讓科學家使用自然語言將研究從意圖轉化為行動，無需手動配置模型、端點或軟件環境。英偉達BioNeMo Agent Toolkit通過提供對加速工作流和模型（如Evo 2、Boltz-2和OpenFold3）的訪問，使受益於加速的分析運行得更快。

科學家首先用自然語言描述一個研究任務，例如分析基因組序列、預測蛋白質結構或設計潛在結合物。Claude Science解釋請求，並通過預配置的領域專業代理來編排工作，這些代理瞭解基因組學、蛋白質組學、單細胞分析、化學信息學和臨牀研究中的既定工作流。

BioNeMo Agent Toolkit為這些代理提供了必要的上下文，將每個步驟與適當的英偉達科學能力連接起來。每個技能包括其用途和所需輸入的信息，幫助代理準備並執行工作流，然後返回輸出供審查。

結果是一個科學推理與加速計算工作之間的迭代循環。科學家可以檢查輸出、完善問題並確定下一步，同時專注於科學本身。

一個有力的例子是生成針對常見癌症靶點的更好抑制劑。在這個工作流中，科學家從已知的致癌抗原突變開始，要求Claude設計大量潛在抑制劑。與BioNeMo Agent Toolkit和英偉達NIM微服務集成的Claude Science加速了高通量抑制劑預測、優化和驗證。

為代理構建的科學基礎

AI代理進行推理、規劃並使用工具完成任務。在生命科學中，這些工具通常是專門的計算工作流。

一個自主的AI科學家代理並非孤立地推理。它可能需要指紋識別化合物庫、聚類有希望的命中物、為頂級候選物生成構象、分析基因組背景並比較擾動響應，然後推薦下一個實驗。

每一步都依賴於一個科學工具，代理的運行速度只能與這些工具的速度相當。

英偉達BioNeMo Agent Toolkit為科學代理提供了以科學速度運行所需的加速工具。它包括：

• 英偉達Parabricks將基因組分析從幾小時縮短到幾分鐘，使代理能夠近乎實時地將基因組背景整合到決策中。
• 由scverse開發的RAPIDS-singlecell將130萬細胞的預處理和聚類工作流從52分鐘壓縮到25秒，使單細胞分析成為推理循環的一部分，而不是離線批量任務。
• nvMolKit將化學信息學操作（如相似性搜索和構象生成）加速高達3000倍，使代理在巨大的化學空間中迭代時以思維速度獲得結果。
• 英偉達BioNeMo開放模型提供由英偉達庫加速的核心生物分子能力，使代理在工作流的每一步都擁有專門構建的科學模型。
• BioNeMo NIM微服務將這些模型打包為企業級推理端點——容器化微服務，預集成並調優完整的加速軟件堆棧，用於高性能推理——使代理能夠為生產部署調用單個穩定的應用程序接口。

英偉達BioNeMo Agent Toolkit是開放的且與框架無關，允許相同的科學技能跨代理框架和研究平台工作。該工具包及其技能現已通過英偉達開發者資源和GitHub提供。

科學家可以通過Anthropic的Claude Science訪問BioNeMo驅動的工作流，該服務現已進入公開測試階段。作為公開測試的一部分，Anthropic邀請研究人員提供關於他們需要的額外領域專家和集成的反饋。