英伟达BioNeMo Agent Toolkit助力生命科学研究人员,与Claude Science集成加速AI应用
英伟达发布了BioNeMo Agent Toolkit,与Anthropic的Claude Science集成,使科学家能通过自然语言与AI代理交互,加速药物发现、基因组学等生命科学研究。该工具包整合了英伟达的加速模型、库和微服务,包括Parabricks、RAPIDS-singlecell和nvMolKit,显著提升计算速度。全球前20大药企中有18家使用英伟达BioNeMo。Claude Science现已进入公开测试。
生命科学已经进入计算规模的时代。十多年来,英伟达构建了完整的GPU加速计算堆栈,涵盖硬件、框架、库、模型、微服务和领域特定工具,帮助研究人员运行更复杂的工作流并更快迭代。本周,Anthropic推出了Claude Science,这是一个面向科学研究的人工智能工作台,允许科学家通过自然语言与代理对话,端到端地执行研究工作。
Claude Science集成了英伟达BioNeMo Agent Toolkit,作为科学家可以在其工作流中访问的资源。该工具包将英伟达加速能力打包为可调用的技能,使Claude Science能够选择合适的工具、准备有效输入并执行工作流——同时连接部署在任何地方的英伟达计算资源。这将英伟达的加速模型、库和NIM微服务直接带入与其余研究相同的环境。
全球最大的制药公司正在利用英伟达技术推进药物发现、基因组学、医学影像、分子设计和蛋白质工程等领域的AI驱动研究。如今,全球前20大制药公司中有18家使用英伟达BioNeMo,突显了其在生态系统中的广泛作用。
推动科学发现的代理时代
Claude Science让科学家使用自然语言将研究从意图转化为行动,无需手动配置模型、端点或软件环境。英伟达BioNeMo Agent Toolkit通过提供对加速工作流和模型(如Evo 2、Boltz-2和OpenFold3)的访问,使受益于加速的分析运行得更快。
科学家首先用自然语言描述一个研究任务,例如分析基因组序列、预测蛋白质结构或设计潜在结合物。Claude Science解释请求,并通过预配置的领域专业代理来编排工作,这些代理了解基因组学、蛋白质组学、单细胞分析、化学信息学和临床研究中的既定工作流。
BioNeMo Agent Toolkit为这些代理提供了必要的上下文,将每个步骤与适当的英伟达科学能力连接起来。每个技能包括其用途和所需输入的信息,帮助代理准备并执行工作流,然后返回输出供审查。
结果是一个科学推理与加速计算工作之间的迭代循环。科学家可以检查输出、完善问题并确定下一步,同时专注于科学本身。
一个有力的例子是生成针对常见癌症靶点的更好抑制剂。在这个工作流中,科学家从已知的致癌抗原突变开始,要求Claude设计大量潜在抑制剂。与BioNeMo Agent Toolkit和英伟达NIM微服务集成的Claude Science加速了高通量抑制剂预测、优化和验证。
为代理构建的科学基础
AI代理进行推理、规划并使用工具完成任务。在生命科学中,这些工具通常是专门的计算工作流。
一个自主的AI科学家代理并非孤立地推理。它可能需要指纹识别化合物库、聚类有希望的命中物、为顶级候选物生成构象、分析基因组背景并比较扰动响应,然后推荐下一个实验。
每一步都依赖于一个科学工具,代理的运行速度只能与这些工具的速度相当。
英伟达BioNeMo Agent Toolkit为科学代理提供了以科学速度运行所需的加速工具。它包括:
- 英伟达Parabricks将基因组分析从几小时缩短到几分钟,使代理能够近乎实时地将基因组背景整合到决策中。
- 由scverse开发的RAPIDS-singlecell将130万细胞的预处理和聚类工作流从52分钟压缩到25秒,使单细胞分析成为推理循环的一部分,而不是离线批量任务。
- nvMolKit将化学信息学操作(如相似性搜索和构象生成)加速高达3000倍,使代理在巨大的化学空间中迭代时以思维速度获得结果。
- 英伟达BioNeMo开放模型提供由英伟达库加速的核心生物分子能力,使代理在工作流的每一步都拥有专门构建的科学模型。
- BioNeMo NIM微服务将这些模型打包为企业级推理端点——容器化微服务,预集成并调优完整的加速软件堆栈,用于高性能推理——使代理能够为生产部署调用单个稳定的应用程序接口。
英伟达BioNeMo Agent Toolkit是开放的且与框架无关,允许相同的科学技能跨代理框架和研究平台工作。该工具包及其技能现已通过英伟达开发者资源和GitHub提供。
科学家可以通过Anthropic的Claude Science访问BioNeMo驱动的工作流,该服务现已进入公开测试阶段。作为公开测试的一部分,Anthropic邀请研究人员提供关于他们需要的额外领域专家和集成的反馈。