NVIDIA BioNeMo Agent ToolkitがClaude Scienceで生命科学研究者に加速AIを提供
NVIDIAはBioNeMo Agent Toolkitを発表し、AnthropicのClaude Scienceと統合することで、科学者が自然言語を用いて創薬、ゲノミクスなどの加速AIワークフローを実行できるようにしました。このツールキットにはParabricks、RAPIDS-singlecell、nvMolKitなどのGPU加速ツールが含まれ、世界のトップ20製薬企業のうち18社がNVIDIA BioNeMoを利用しています。Claude Scienceは現在パブリックベータ版です。
生命科学は計算スケールの時代に入り、10年以上にわたりNVIDIAはハードウェア、フレームワーク、ライブラリ、モデル、マイクロサービス、ドメイン特化ツールにわたる完全なGPUアクセラレーテッドコンピューティングスタックを構築し、研究者がより高度なワークフローを実行し、より速く反復できるよう支援してきました。今週、AnthropicはClaude Scienceを発表しました。これは科学研究のためのAIワークベンチで、科学者が自然言語でエージェントと対話しながら研究をエンドツーエンドで実行できるようにします。
Claude ScienceはNVIDIA BioNeMo Agent Toolkitと統合されており、科学者はワークフロー内でこのリソースにアクセスできます。このツールキットはNVIDIAのアクセラレーテッド機能を呼び出し可能なスキルとしてパッケージ化し、Claude Scienceが適切なツールを選択し、有効な入力を準備し、ワークフローを実行できるようにします。これにより、NVIDIAのアクセラレーテッドモデル、ライブラリ、NIMマイクロサービスが、研究の残りの部分と同じ環境に直接もたらされます。
世界最大の製薬企業は、創薬、ゲノミクス、医用画像、分子設計、タンパク質工学にわたるAI対応研究を進めるためにNVIDIAテクノロジーを利用しています。現在、トップ20の製薬企業のうち18社がNVIDIA BioNeMoを使用しており、エコシステム全体でのその役割の広さを裏付けています。
科学的発見のエージェント時代を推進
Claude Scienceにより、科学者は自然言語を使用して、モデルやエンドポイント、ソフトウェア環境を手動で設定することなく、研究を意図から行動に移すことができます。NVIDIA BioNeMo Agent Toolkitは、Evo 2、Boltz-2、OpenFold3などのアクセラレーテッドワークフローやモデルへのアクセスを提供し、高速化の恩恵を受ける分析をより速く実行できるようにします。
科学者はまず、ゲノム配列の解析、タンパク質構造の予測、潜在的な結合剤の設計などの研究タスクを自然言語で記述します。Claude Scienceはリクエストを解釈し、ゲノミクス、プロテオミクス、単一細胞解析、ケモインフォマティクス、臨床研究にわたる確立されたワークフローを知っている事前設定されたドメイン特化エージェントを通じて作業をオーケストレーションします。
BioNeMo Agent Toolkitは、これらのエージェントに各ステップを適切なNVIDIAの科学的能力に接続するために必要なコンテキストを提供します。各スキルにはその目的と必要な入力に関する情報が含まれており、エージェントがワークフローを準備して実行し、レビューのための出力を返すのを支援します。
結果は、科学的推論と高速計算作業の間の反復ループです。科学者は出力を検査し、質問を洗練し、次のステップを決定しながら、科学に集中し続けることができます。
強力な例の1つは、一般的ながん標的のより良い阻害剤を生成することです。このワークフローでは、科学者は既知の発がん性抗原変異から始め、Claudeに多数の潜在的な阻害剤を設計するよう依頼します。BioNeMo Agent ToolkitとNVIDIA NIMマイクロサービスと統合されたClaude Scienceは、ハイスループットの阻害剤予測、最適化、検証を加速します。
エージェントのために構築された科学基盤
AIエージェントは推論し、計画し、ツールを使用してタスクを完了します。生命科学では、それらのツールは多くの場合、専門的な計算ワークフローです。
自律的なAI科学者エージェントは孤立して推論するわけではありません。化合物ライブラリのフィンガープリント、有望なヒットのクラスタリング、トップ候補のコンフォーマー生成、ゲノムコンテキストの分析、摂動応答の比較を行ってから、次の実験を推奨する必要があるかもしれません。
各ステップは科学ツールに依存しており、エージェントはそれらのツールが実行されるのと同じ速さでしか動作できません。
NVIDIA BioNeMo Agent Toolkitは、科学エージェントに科学の速度で動作するために必要な加速ツールを提供します。これには以下が含まれます：
- NVIDIA Parabricksはゲノム解析を数時間から数分に短縮し、エージェントがゲノムコンテキストをほぼリアルタイムで意思決定に統合できるようにします。
- scverseが開発したRAPIDS-singlecellは、130万セルの前処理とクラスタリングワークフローを52分から25秒に圧縮し、単一細胞解析が推論ループの一部となり、オフラインのバッチジョブではなくなります。
- nvMolKitは類似性検索やコンフォーマー生成などのケモインフォマティクス操作を最大3,000倍高速化し、エージェントが膨大な化学空間を反復する際に思考の速度で結果を得られるようにします。
- NVIDIA BioNeMoオープンモデルは、NVIDIAライブラリによって加速されたコア生体分子機能を提供し、エージェントがワークフローの各ステップに専用に構築された科学モデルを持てるようにします。
- BioNeMo NIMマイクロサービスは、これらのモデルをエンタープライズ対応の推論エンドポイントとしてパッケージ化します。完全な加速ソフトウェアスタックが事前統合され、高性能推論用に調整されたコンテナ化マイクロサービスであり、エージェントが本番展開用に単一の安定したAPIを呼び出せるようにします。
NVIDIA BioNeMo Agent Toolkitはオープンでハーネスに依存せず、同じ科学スキルをさまざまなエージェントフレームワークや研究プラットフォームで機能させることができます。ツールキットとそのスキルは、NVIDIAの開発者リソースおよびGitHubから入手可能です。
科学者は、AnthropicのClaude Scienceを通じてBioNeMo対応のワークフローにアクセスできます。Claude Scienceは現在パブリックベータ版です。パブリックベータの一環として、Anthropicは研究者に追加のドメイン専門家や統合に関するフィードバックを提供するよう呼びかけています。