從標準病理切片推斷腫瘤中的多細胞相互作用
斯坦福醫學研究人員開發了一種人工智慧平臺,能夠從標準的腫瘤組織顯微切片中預測細胞鄰域,揭示腫瘤內細胞之間的複雜相互作用。該平臺在非小細胞肺癌中識別出10種細胞鄰域,其中一種富含中性粒細胞的鄰域與較差的預後和免疫治療耐藥性相關。這項技術有望為癌症研究和臨床決策提供新的工具。
斯坦福大學醫學院的研究人員近日開發出一種名為CANVAS的人工智慧平臺,該平臺能夠從標準的H&E染色病理切片中,推斷出腫瘤組織內部的細胞鄰域及其相互作用。這一成果為癌症研究提供了一個強大的新工具,有望改善患者的預後評估和治療方案選擇。
腫瘤並非孤立存在的細胞團塊,而是由癌細胞、免疫細胞、基質細胞等多種細胞型別組成的複雜生態系統。這些細胞之間的相互作用對於瞭解腫瘤的結構、患者免疫應答以及治療敏感性至關重要。然而,傳統的空間分析方法(例如CODEX)雖然能提供高解析度的細胞圖譜,但耗時且成本高昂,限制了其廣泛應用。
為了解決這一難題,由放射腫瘤學副教授Ruijiang Li博士領導的團隊,構建了一個包含超過1800萬個細胞的圖譜,這些細胞來自457名非小細胞肺癌患者的樣本。他們將CODEX實驗獲得的細胞鄰域資訊與對應H&E切片進行逐細胞匹配,訓練AI學習切片上的形態學模式與細胞鄰域的對應關係。
這一過程受益於團隊此前開發的MUSK人工智慧工具,該工具已在5000萬張病理影像和超過10億條病理文本資料上進行了預訓練,擅長識別切片中的形態模式。CANVAS則在此基礎上,進一步推斷出複雜的多細胞模式。
利用CANVAS,研究人員在非小細胞肺癌中識別出了10種不同的細胞鄰域,這些鄰域不僅由細胞型別和位置定義,還包含了它們的分子活動資訊。其中一個富含中性粒細胞的鄰域引起了特別關注,因為它與患者較差的總體預後以及對PD-1抑制劑等免疫治療藥物的耐藥性顯著相關。
研究還發現,CANVAS預測的免疫治療響應比目前臨床常用的生物標誌物方法更為準確,這表明該平臺有潛力指導臨床決策。該平臺已在超過5000名患者、涵蓋9種癌症型別的檔案切片中進行了驗證,證實了這些細胞鄰域的普遍性。
Li博士表示,下一步計劃在臨床試驗中驗證CANVAS,以確認其預測患者預後和治療反應的能力。該研究於2026年6月16日發表在《細胞》雜誌上,由Broad研究所、哈佛醫學院和MD安德森癌症中心的研究人員共同參與。