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从标准病理切片推断肿瘤中的多细胞相互作用

文章摘要

斯坦福医学研究人员开发了一种人工智能平台,能够从标准的肿瘤组织显微切片中预测细胞邻域,揭示肿瘤内细胞之间的复杂相互作用。该平台在非小细胞肺癌中识别出10种细胞邻域,其中一种富含中性粒细胞的邻域与较差的预后和免疫治疗耐药性相关。这项技术有望为癌症研究和临床决策提供新的工具。

来源Hacker News AI作者: hhs
从标准病理切片推断肿瘤中的多细胞相互作用
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斯坦福大学医学院的研究人员近日开发出一种名为CANVAS的人工智能平台,该平台能够从标准的H&E染色病理切片中,推断出肿瘤组织内部的细胞邻域及其相互作用。这一成果为癌症研究提供了一个强大的新工具,有望改善患者的预后评估和治疗方案选择。

肿瘤并非孤立存在的细胞团块,而是由癌细胞、免疫细胞、基质细胞等多种细胞类型组成的复杂生态系统。这些细胞之间的相互作用对于了解肿瘤的结构、患者免疫应答以及治疗敏感性至关重要。然而,传统的空间分析方法(例如CODEX)虽然能提供高分辨率的细胞图谱,但耗时且成本高昂,限制了其广泛应用。

为了解决这一难题,由放射肿瘤学副教授Ruijiang Li博士领导的团队,构建了一个包含超过1800万个细胞的图谱,这些细胞来自457名非小细胞肺癌患者的样本。他们将CODEX实验获得的细胞邻域信息与对应H&E切片进行逐细胞匹配,训练AI学习切片上的形态学模式与细胞邻域的对应关系。

这一过程受益于团队此前开发的MUSK人工智能工具,该工具已在5000万张病理图像和超过10亿条病理文本数据上进行了预训练,擅长识别切片中的形态模式。CANVAS则在此基础上,进一步推断出复杂的多细胞模式。

利用CANVAS,研究人员在非小细胞肺癌中识别出了10种不同的细胞邻域,这些邻域不仅由细胞类型和位置定义,还包含了它们的分子活动信息。其中一个富含中性粒细胞的邻域引起了特别关注,因为它与患者较差的总体预后以及对PD-1抑制剂等免疫治疗药物的耐药性显著相关。

研究还发现,CANVAS预测的免疫治疗响应比目前临床常用的生物标志物方法更为准确,这表明该平台有潜力指导临床决策。该平台已在超过5000名患者、涵盖9种癌症类型的档案切片中进行了验证,证实了这些细胞邻域的普遍性。

Li博士表示,下一步计划在临床试验中验证CANVAS,以确认其预测患者预后和治疗反应的能力。该研究于2026年6月16日发表在《细胞》杂志上,由Broad研究所、哈佛医学院和MD安德森癌症中心的研究人员共同参与。

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要点

  • 斯坦福团队开发了名为CANVAS的AI平台,可从H&E染色切片推断肿瘤细胞邻域。
  • 通过对457名非小细胞肺癌患者的1800多万细胞进行分析,确定了10种不同的细胞邻域。
  • 一种富含中性粒细胞的邻域与较差的总体预后及免疫治疗耐药性相关。
  • CANVAS的预测能力优于当前用于评估免疫治疗候选者的方法。

要点与分析由自动化流程生成,可能有误,请结合原始来源核实。