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結合對比學習的聯合嵌入預測:面向結構MRI的表徵學習新框架

文章摘要

自監督學習在醫學影像領域潛力巨大,但標註資料稀缺。本文提出COJEPA框架,結合聯合嵌入預測架構和對比損失,在無標註的T1加權腦部MRI上訓練,實現了優異的區域性預測性和全域性判別性。在零樣本雙胞胎檢索、腦腫瘤分割和年齡迴歸任務中表現突出,尤其在同卵雙胞胎識別和年齡預測誤差方面達到最先進水平。

來源arXiv Computer Vision作者: Fabian Mager, Lars Kai Hansen
結合對比學習的聯合嵌入預測:面向結構MRI的表徵學習新框架
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自監督學習因能利用海量無標註資料,在醫學影像領域備受關注,但如何設計有效的預訓練任務仍具挑戰。近日,研究人員提出COJEPA框架,旨在為三維腦部MRI學習兼具區域性預測性與全域性判別性的表徵。該工作已被提交至arXiv,並於2026年7月12日釋出。

COJEPA的核心創新在於融合兩種互補的學習目標:聯合嵌入預測架構(JEPA)和對比損失(CO)。JEPA透過預測輸入影像中掩蔽區域的嵌入表示,迫使模型學習區域性結構資訊;而對比損失則透過拉近相似樣本、推開不同樣本的嵌入,增強全域性判別能力。兩者結合使得COJEPA同時具備精細的空間感知和魯棒的語義區分性。

在技術實現上,COJEPA將I-JEPA擴充套件至三維,採用前景感知塊掩蔽策略,優先遮擋腦組織區域,並引入分層卷積塊嵌入和世界空間正弦位置編碼,以高效處理高解析度體積資料。模型在兩個公開資料集HCP-YA和AABC上訓練,共計2286例,年齡跨度22至90歲。這種設計使得模型能夠從無標註的三維腦部MRI中學習到豐富的結構和語義資訊。

研究者在三個下游任務上評估了COJEPA的效能:零樣本雙胞胎檢索、腦腫瘤分割(BraTS 2024)和年齡迴歸(OpenBHB)。COJEPA在同卵雙胞胎檢索中以rank@1召回率0.84領先,這意味著在給定一個受試者的情況下,模型能夠以84%的機率正確識別其同卵雙胞胎。在年齡迴歸任務中,微調後的平均絕對誤差僅2.55年,為最佳結果,表明模型能夠準確預測個體的年齡。在BraTS全腫瘤分割Dice係數上,COJEPA與純對比損失方法持平,達到了0.85以上的Dice得分。這些結果充分表明,聯合目標能夠產生既具判別性又保持區域性結構的優質表徵。

該工作為醫學影像自監督學習提供了新思路,尤其在標註成本高昂的場景下,COJEPA有望推動腦部MRI分析的發展。未來研究可進一步探索其在其他模態如fMRI、DTI以及疾病診斷如阿爾茨海默病、精神分裂症等中的應用。此外,COJEPA的框架也可推廣到其他三維醫學影像如CT掃描。

展開要點與分析

文章情報

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要點

  • COJEPA將聯合嵌入預測架構(JEPA)與對比損失(CO)相結合,同時提升區域性預測性和全域性判別性。
  • 該框架在2286例T1加權結構MRI資料上訓練,擴充套件I-JEPA至3D,採用前景感知塊掩蔽、分層卷積塊嵌入和世界空間正弦位置編碼。
  • 在雙胞胎檢索(rank@1同卵雙胞胎召回率0.84)、年齡迴歸(MAE 2.55年)和腦腫瘤分割(與CO匹配的全腫瘤Dice)任務上均取得最優或相當效能。

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