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使用ChEMBL、RDKit、SHAP和BRICS构建基于骨架分割随机森林QSAR的EGFR抑制剂发现AI合作科学家

本教程介绍如何构建一个端到端的自主AI合作科学家工作流程,用于发现针对非小细胞肺癌中C797S奥希替尼耐药突变的新一代EGFR抑制剂。流程包括通过ChEMBL和UniProt解析靶点、挖掘IC50数据并转换为pIC50数据集、使用RDKit标准化分子、计算摩根指纹、训练基于骨架分割的随机森林QSAR模型、使用SHAP解释活性驱动因素,以及通过BRICS片段重组生成并筛选新型候选分子。

来源MarkTechPost作者: Sana Hassan
使用ChEMBL、RDKit、SHAP和BRICS构建基于骨架分割随机森林QSAR的EGFR抑制剂发现AI合作科学家
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工程师进阶

要点

  • 构建了一个从靶点解析到候选分子生成的完整AI工作流程。
  • 使用ChEMBL和UniProt获取EGFR C797S相关的生物活性数据。
  • 基于骨架分割训练随机森林QSAR模型,确保对新颖化学类型的泛化能力。
  • 通过BRICS片段重组生成新型药物类似物,并评估其活性、类药性、可合成性和新颖性。

要点与分析由自动化流程生成,可能有误,请结合原始来源核实。