百时美施贵宝购买英伟达AI系统用于药物发现
百时美施贵宝将购买基于英伟达Vera Rubin架构的DGX SuperPOD,用于支持其药物发现和开发过程中的人工智能应用。这家制药公司表示,它将成为首家获得基于Vera Rubin的DGX SuperPOD的生命科学企业。该系统将提供10倍于现有基础设施的性能功耗比,并支持化合物、蛋白质等科学数据的模型训练与预测。
百时美施贵宝(Bristol Myers Squibb,简称BMS)宣布购买英伟达(Nvidia)的DGX SuperPOD,该系统基于英伟达最新的Vera Rubin架构,旨在支持该公司在药物发现和开发中的人工智能应用。BMS表示,它将成为第一家获得基于Vera Rubin的DGX SuperPOD的生命科学公司。Vera Rubin架构是英伟达今年早些时候推出的,作为其当前一代AI计算系统的继任者。
该新集群将包含八个DGX Vera Rubin NVL72系统,每个机架级系统结合了英伟达Vera中央处理器和Rubin图形处理器。BMS将利用这些基础设施在其研究项目中训练专有模型并进行预测,涵盖化合物、蛋白质及其他科学数据。财务条款未予披露。此项购买扩展了BMS现有的英伟达基础设施,其中包含一个较旧的SuperPOD,公司高管称其比Vera Rubin落后两到三代。
BMS现有的DGX SuperPOD已运行约三年。公司计划将其与Vera Rubin系统结合,形成一个共享计算环境,可供全球研究站点访问。SuperPOD的软件栈可以调度训练、预测和开发工作负载。BMS表示,扩展后的环境将使更多科学家直接获得计算资源。
BMS首席数字与技术官Greg Meyers指出,随着公司在研究组织中部署更大规模的AI模型,计算需求不断增加。研究业务洞察与技术副总裁Erin Davis表示,现有基础设施已满负荷运行,原因在于涉及大分子的大规模预测以及内部基础模型的开发。Davis强调,新系统将不会仅限于少数计算研究人员,BMS计划将其开放给整个研究组织,无需等待或设置访问限制。
在药物发现方面,BMS表示AI已应用于每个小分子项目和大多数大分子项目的设计。该技术用于靶点识别、先导化合物优化、大分子预测及内部模型开发。AI驱动的靶点识别已将一些手动研究工作缩短数周。大分子预测工作负载也推动了对额外图形处理器容量的需求。
BMS首席研究官Robert Plenge表示,新系统将使科学家在早期开发阶段评估更多潜在候选药物。“也许以前我们只能做10个,现在我们可以做几十个。”计算筛选使研究人员能够在选择少量化合物进行合成和实验室测试之前,先评估潜在的化合物。BMS通过其称为“预测优先”(Predict First)的方法应用此策略,利用模型生成的预测排除不符合所需特性的分子。
治疗发现科学高级副总裁Payal Sheth解释说,研究人员使用预测来识别具有所需特性组合的分子。“我们将预测作为优先合成具有多参数优化能力的分子的手段。这确保了宝贵的实验室实验与具有最高成功概率的分子保持一致。”该方法缩小了送到实验室测试的化合物数量,使实验聚焦于符合预测要求的分子。
BMS还利用AI扩展其CELMoD化合物库,这类化合物被设计用于选择性降解致癌蛋白质。公司正在研究这些化合物在血液癌症及其他疾病中的应用。建模工作帮助研究人员在决定哪些候选物进行实验之前,检查更多的蛋白质靶点和潜在化合物。
此外,BMS使用AI工具缩短生产临床试验药物所需的时间。Plenge表示,这一过程已减少20%到30%,未来几年可能达到50%。他引用一个实验性镰状细胞病治疗作为AI支持研究的例子,称该治疗可能无法在没有AI工具的情况下被发现。这些数字指的是识别和产生候选物进行临床测试所需的时间,而非它们在试验中的后续表现。
Vera Rubin系统还将使研究人员能够访问英伟达的BioNeMo Agent Toolkit,用于生物学和药物发现应用。BioNeMo提供蛋白质结构预测、分子生成、分子对接、序列分析和基因组学工具,并能将多个计算工具连接在同一研究流程中。BMS高管表示,人类研究人员将继续审查模型输出,并决定哪些化合物或项目应该推进。
BMS正在引入旨在减少启动复杂计算任务所需专业知识的工具。公司表示,研究人员将能够使用自然语言指令启动一些预测请求。该环境将通过英伟达Mission Control管理,其功能包括集群配置、基础设施监控和工作负载管理。
统一基础设施将允许一个站点生成的数据和模型输出被其他团队使用。例如,新泽西州劳伦斯维尔项目的数据集可以被圣地亚哥的研究人员用于模型。Sheth表示,共享环境旨在保存整个组织的实验和研究项目信息。“计算基础设施将所有科学家连接起来,确保我们的学习成果制度化。”两个SuperPOD将通过一个公共数据环境运行,使不同站点的团队能够访问共享数据集和模型输出。环境将包括来自实验、临床读取和研究合作的信息。
公司计划将新的计算能力分配给小分子和大分子设计、临床研究和数字孪生应用。BMS未提供计划中的数字孪生工作详情或分配给每个区域的计算容量。
Meyers表示,Vera Rubin系统将提供相对于用电量更多的计算能力。BMS和英伟达称,八个系统集群的性能功耗比将是其替换的基础设施的10倍。“当你托管这些系统时,你必须支付电费。可以将其视为每瓦特功耗10倍的计算能力……电力不会变得更便宜。”BMS未提供具体的部署日期或新系统的主机位置。