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Anthropic与Modal集成,为Claude Science带来可扩展计算能力

Anthropic推出Claude Science,这是一个面向生命科学研究人员的AI工作台,集成了Modal的弹性计算基础设施,使研究人员能在对话中直接运行从数据处理到分子设计的计算密集型工作负载。

6月30日,Anthropic正式推出Claude Science——一款面向生命科学研究人员的AI工作台。该平台允许科学家直接在对话中运行计算工作负载,涵盖数据处理流程、蛋白质结构预测、分子设计等任务。最复杂的生命科学问题不仅需要最先进的AI模型,还需要一流的基础设施支撑。对蛋白质语言模型进行推理、筛选包含数百万化合物的文库,这些计算密集型工作必须能够按需扩展,并在完成后立即释放资源。Anthropic自豪地宣布与Modal合作,为Claude Science提供计算支持。

计算生物学的工具链困境 大多数生命科学流程跨越本地机器、HPC集群、云虚拟机以及多种生物信息学工具。典型的工作流程包括:配置资源或提交作业队列、通过SSH连接服务器、搭建环境、运行作业、探索和分析结果,然后为每个工作负载重复这些步骤。Claude Science将这些工作整合到一个平台中。研究人员可以直接在对话中运行代码。默认情况下,代码在研究人员机器的沙箱环境中执行,这足以满足早期分析需求。但计算生物学工作流常常从小规模开始,逐渐变得复杂。这时Modal介入,在需要时自动提供更多计算容量,无需研究人员进行任何额外操作。在Claude Science中,研究人员可以连接自己的Modal工作空间。需要GPU或多核CPU的工作负载会自动路由到Modal沙箱。研究人员无需离开Claude界面,Modal负责处理计算:那些任何固定集群或单一GPU类型都无法满足的突发性、异构工作负载。

Modal带来的可能性

  • 并行扩展:变异分析、虚拟筛选和序列注释都是高度并行的任务。针对大型化合物文库的虚拟筛选,顺序执行可能需要数小时,但通过数百个Modal容器并行处理,几分钟即可完成。Modal负责调度,Claude负责编写Python代码。
  • 按步骤GPU访问:生物学流程很少完全依赖GPU或CPU。典型的工作流可能先在CPU上进行比对和预处理,然后交给ESMFold2等模型在GPU上进行结构预测。Modal允许为特定函数请求GPU,而不是为整个流程分配。
  • 跨任务共享存储:在流程步骤之间移动测序数据集、蛋白质数据库和模型检查点代价高昂。Modal卷可以在所有作业之间共享数据,无论是一个查询还是数千个。
  • 可复现环境:Modal镜像使每个计算任务的依赖管理变得简单,确保环境简洁且一致,避免团队其他成员复现结果时出现意外。

生物学团队已在Modal上运行 Chai Discovery构建了基于机器学习的药物发现流程,该流程整合了蛋白质嵌入、多序列比对和抗体设计模型,每个步骤都在最合适的硬件上运行。机器学习研究员Kevin Wu表示:“我们有许多不同的模型,它们从不同层面提供对蛋白质的见解。能够在合适的硬件上运行所有这些模型,正是产品成功的关键。”这些工作负载具有突发性:某天可能闲置,第二天却需要数百个GPU。Wu补充道:“有时我们会同时启动数百个GPU,几分钟内就能完成配置,无需繁琐的配置或仪表板,这简直是个奇迹。”Claude Science将同样弹性、可复现的基础设施带给那些从未接触过MLops的研究人员。

Claude Science的实际应用 最简单的模式是单个提示。研究人员输入“使用Modal GPU预测GFP的3D结构,并显示预测结构及其置信度分数”,Claude编写折叠代码,在连接的Modal工作空间上运行,然后返回结构及每个残基的置信度,所有操作都在对话中完成。

  • 多模型酶工程:研究人员上传酶序列,要求Claude优先筛选出可能增强活性的突变,并使用多种方法评分。Claude表征蛋白质,用ESMFold折叠,然后使用ESM-2、ProteinMPNN和ESM-IF三种不同模型对每个单点突变进行评分。Modal为每个步骤提供所需硬件,Claude对候选突变进行排序并在结构上呈现。
  • 全基因组CRISPR敲除筛选:设计针对人类所有激酶的敲除筛选,包括选择向导、预测脱靶效应、规划测序深度。脱靶搜索是最昂贵的步骤:每个候选向导都需要与整个人类基因组进行近匹配检查。顺序执行速度极慢,但通过数百个Modal容器并行处理,数千个向导在几分钟内完成筛选。Claude汇总结果,标记风险向导,并组装可直接用于构建的文库。
  • 单细胞分析:寻找比较免疫治疗前后肿瘤活检的研究,并识别哪些免疫细胞群在治疗后扩增或收缩。Claude定位数据集,构建单细胞对象,聚类并注释细胞类型,识别免疫细胞群的变化。

如何开始 Claude Science于6月30日上线。要使用Modal作为计算后端:从claude.com/science下载Claude Science应用;在设置中进入计算配置部分;连接到你的Modal工作空间(如果没有Modal账户,可在modal.com/signup注册,只需几分钟,并包含30美元免费计算额度);连接后,计算工作负载将自动在Modal上运行。

生命科学部门的计算支持 Claude Science专为大学和机构的研究人员设计,不仅限于商业生物技术公司。通过本次发布,Modal为生命科学部门提供计算资源。Anthropic承诺提供高达10万美元的计算资源,支持Anthropic AI for Science Claude Science Cohort,每个项目分配500至2000美元。申请截止日期为2026年7月15日,获奖通知将于7月31日发出。项目将从2026年9月1日运行至12月1日。立即申请。