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MONAIを使用したエンドツーエンドの3D脾臓セグメンテーションのコーディング実装(医用CTボリューム上のUNetを使用)

このチュートリアルでは、MONAIを使用してMedical Segmentation Decathlon Task09データセットで脾臓をセグメンテーションするエンドツーエンドの3D医用画像セグメンテーションパイプラインを構築します。CTボリュームデータの処理、医用画像変換(方向調整、ボクセル間隔正規化、輝度ウィンドウイング、前景クロッピング、パッチベースのサンプリング)を行い、3D UNetモデルを訓練して二値臓器セグメンテーションを実行します。混合精度訓練、DiceCE損失、スライディングウィンドウ推論、Diceベースの検証、定性可視化を採用し、生の医用ボリュームから完全な訓練-検証-可視化セグメンテーションシステムへと移行します。

ソースMarkTechPost著者: Sana Hassan
MONAIを使用したエンドツーエンドの3D脾臓セグメンテーションのコーディング実装(医用CTボリューム上のUNetを使用)
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エンジニア上級

要点

  • MONAIと3D UNetを使用したCTボリューム上の脾臓セグメンテーション。
  • データ前処理、拡張、訓練、検証、可視化の完全なパイプライン。
  • 混合精度訓練とDiceCE損失による最適化。
  • スライディングウィンドウ推論とDiceメトリクスによる性能評価。

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